圓柏屬（Juniperus）和側柏屬（Thuja）是兩個不同的屬，它們在植物分類學上有以下主要區別：

1. 植物科屬：圓柏屬屬于柏科（Cupressaceae），而側柏屬屬于柏木科（Cupressaceae）。

2. 樹木形態：兩個屬的樹木形態有所不同。圓柏屬的植物多為喬木、灌木狀，可以長成較高的樹木；而側柏屬的植物通常為中等大小的喬木或觀賞灌木。

3. 葉子形態：圓柏屬的植物葉子呈針狀或鱗片狀，排列緊密，顏色多為深綠色。而側柏屬的植物葉子也是鱗片狀，但相對較扁平，顏色通常為淺綠色。

4. 地理分布：圓柏屬植物廣泛分布在北半球的溫帶和寒帶地區，包括歐洲、亞洲和北美洲；而側柏屬的植物主要分布在北美洲，尤其在東部和中部地區。

雖然圓柏屬和側柏屬在一些特征上有區別，但它們都屬于柏目（Cupressales）的科屬之一，具有柏科植物的一般特征，如常綠性、木本性和鱗片狀葉子。